在高效液相色譜儀分析過程中，緩沖液是不可或缺的，因為要用它來調節流動相的pH值，緩沖鹽使用不當，后果可是吃不了兜著走。比如說，液相色譜儀的色譜柱壓升高、柱效下降、保留時間異常等等不良影響：
　　1、柱壓升高；
　　原因：緩沖鹽使用不當導致緩沖鹽析出，堵塞塞板和鍵合相顆粒之間的孔隙，阻礙流動相傳質，引起柱壓升高。
　　2、相同化合物的保留時間發生變化；
　　原因：如果沒有沖洗干凈就進行進樣，色譜柱內含有的鹽會使化合物的保留時間發生變化.
　　3、柱效下降；
　　原因：
　　i、有些緩沖鹽會滲入到鍵合相的深處，損害硅膠基體，導致色譜柱鍵合相流失，柱床變松，柱效下降；
　　ii、凝結在鍵合相表面，使C18碳鏈難以舒展，對物質的保留能力下降，導致柱效下降。因此液相色譜儀用過緩沖鹽后需要對色譜柱進行沖洗，水中緩沖鹽濃度較大時應特別引起注意。